Il protocollo PRTR si basa sugli stessi principi dell'EPER ma ne supera la portata in quanto prevede obblighi di comunicazione dei dati per un numero maggiore di sostanze inquinanti, per un numero maggiore di attività, per le emissioni nel suolo, per le emissioni da fonti diffuse e per i trasferimenti fuori sito.
Het PRTR-protocol gaat uit van dezelfde beginselen als EPER, maar reikt verder doordat het voorziet in rapportage over een groter aantal verontreinigende stoffen, een groter aantal activiteiten, uitstoot in de bodem, uitstoot door diffuse bronnen en overbrengingen van bedrijfsterreinen naar elders.